メタバーコーディング共著論文

平井です。共著で入っていた日本周辺の動物プランクトンのメタバーコーディングに関する論文がPeerJから公開されています。

 

https://peerj.com/articles/15427/

 

重要種のメタバーコーディング参照配列を追加し、メタバーコーディングの精度がどれほど検証するかを検証しています。参照配列の充実度については国際WGのMetaZooGene Database (https://www.st.nmfs.noaa.gov/copepod/collaboration/metazoogene/atlas/index.html) でも情報が整理されてますが、日本周辺海域を含む西部北太平洋は各種の配列登録が必要な地域の一つです(それでもインド洋や南太平洋に比べるとデータは多いですが)。参照配列の追加は時間・労力がかかるため敬遠しがちなのですが、今回の論文でも報告しているようにメタバーコーディングの精度向上には参照配列の充実が必須です。今後も各種の遺伝子配列の蓄積を少しずつでも進めていかなくてはいけません。

 

2023年06月07日