サフィリナの新種記載論文

平井です。共著者として参加した下記の新種記載の論文が公開されました。


Takahashi K, Itoh H, Hirai J, Tadokoro K, Nishiuchi K (2022) A new species of genus Sapphirina(Copepoda, Cyclopoida) from the Kuroshio Extension region in the western North Pacific Ocean. Plankton and Benthos Research, 17: 358-368.

論文では移行域に主に分布が確認されている新種Sapphirina doliolettaeを報告しています。この種名はウミタルDoliolettaを捕食することが報告されていることからきています(Takahashi et al. 2013)。自分は途中参加で遺伝子解析を担当し、COIと18Sの配列取得、同属の種との比較を行いました。データベースにあるサフィリナの18Sがほぼ全長だったので、今回はじめてプライマーウォーキングで18Sのほぼ全長を取得してみました。思ったよりも簡単に配列が取得出来たので、メタバーコーディングの参照配列として18Sは長い配列を取得してもよさそうです。また、思ったよりデータベース上に配列がなく、参照配列登録もまだまだ頑張らないといけなそうです。論文はオープンアクセスで閲覧可能です。


https://www.jstage.jst.go.jp/article/pbr/17/4/17_P170402/_article/-char/en

2022年11月30日